Приложение А (справочное). Оценка целостности РНК

Приложение А
(справочное)

Оценка целостности РНК

Методы оценки целостности РНК с использованием формата капиллярного электрофореза включают число целостности РНК, RIN, и оценку целостности РНК, RIS [2], [31], [32]. RIN получают электрофорезом и используют для оценки интактности РНК, показывая детальную картину распределения фрагментов РНК по размерам [2], [35]. Разработан программный алгоритм, способный оценивать качество РНК лучше, чем рибосомные соотношения. Для электрофореза широко используют автоматические системы в сочетании с микрофлюидными чипами, индуцированным напряжением, разделением размеров и с детекцией флуоресценции. Молекулы РНК окрашивают интеркалирующим красителем и обнаруживают с помощью вышеуказанной автоматической системы. Данные RIN также анализируют по электроферограммам в системе. На электроферограммах и геле деградация рРНК отражается сдвигом в сторону более коротких фрагментов. RIN образца назначается в диапазоне от 10 (интактный) до 1 (полностью деградированный). Еще одним способом определения целостности РНК является расчет RIS с помощью системы QIAxcel (Qiagen) с использованием капиллярного электрофореза высокого разрешения и программного алгоритма, отличного от RIN.