Вы можете открыть актуальную версию документа прямо сейчас.
Если вы являетесь пользователем интернет-версии системы ГАРАНТ, вы можете открыть этот документ прямо сейчас или запросить по Горячей линии в системе.
Вход
- Главная
- Национальный стандарт РФ ГОСТ Р ИСО 20397-2-2023 "Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование. Часть 2. Оценка качества данных секвенирования" (утв. и введен в действие приказом Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии от 10 августа 2023 г. N 633-ст)
- Приложение С (справочное). Программное обеспечение для выравнивания и сопоставления последовательностей
Приложение С (справочное). Программное обеспечение для выравнивания и сопоставления последовательностей
Приложение С
(справочное)
Программное обеспечение для выравнивания и сопоставления последовательностей
В таблице С.1 представлены примеры программного обеспечения для выравнивания и сопоставления последовательностей.
Таблица С.1 - Программное обеспечение для выравнивания и картирования последовательностей
|
Описание функций |
Программное обеспечение/инструменты |
|
Выравнивание или картирование |
Blast, Blat, SOAP, BWA, Bowtie2 и т.д. |
|
Оценка участков сплайсинга в анализе РНК-секвенирования |
|
|
Визуализация для представления выравнивания |
|
|
Примечание 1 - Программное обеспечение регулярно обновляется и значительно зависит/связано с платформами, приложениями и данными о последовательности. Эти примеры актуальны в июне 2020 г. Примечание 2 - Примеры программного обеспечения, перечисленные в данной таблице, являются подходящим доступным программным обеспечением. Данная информация приведена для удобства пользователей настоящего стандарта и не означает одобрения указанного продукта со стороны ИСО. | |