Приложение 3. Список рекомендуемого оборудования (расходных материалов) и его примерное размещение в рабочих зонах (помещениях) лаборатории, использующей МАНК в соответствии с этапами проведения анализа

Приложение 3

Список рекомендуемого оборудования (расходных материалов) и его примерное размещение в рабочих зонах (помещениях) лаборатории, использующей МАНК в соответствии с этапами проведения анализа.

Рабочая зона 1

1. Бокс биологической безопасности III класса защиты или бокса биологической безопасности II класса защиты.

2. Центрифуга для пробирок объемом 5-100 мл до 3 тыс. об/мин.

3. Микроцентрифуга/вортекс.

4. Настольная центрифуга для микропробирок типа "Эппендорф" объемом 1,5 -2 мл до 10000g.

5. Твердотельный термостат для пробирок объемом 1,5 мл с диапазоном рабочих температур 25-100°C.

6. Термостатируемый шейкер для пробирок.

7. Установка для фильтрования воды с набором фильтров.

8. Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема.

9. Одноразовые полипропиленовые завинчивающиеся или плотно закрывающиеся микропробирки на 1,5 мл или 2,0 мл.

10. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с фильтром до 200 и до 1000 мкл.

11. Штативы для наконечников, микропробирок объемом 1,5 мл.

12. Комбинированный холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°C и не выше минус 16°C (для хранения исследуемого материала). Возможно, отдельное использование холодильника с камерой поддерживающей температуру от 2 до 8°C и морозильника, с камерой поддерживающей температуру не выше минус 16°C.

13. Морозильная камера на минус 70°C (при необходимости, в случае длительного хранения материала).

14. Емкость с регламентируемым дезинфицирующим раствором.

15. Емкость с 70% этиловым спиртом.

Рабочая зона 2

1. Бокс биологической безопасности II или III класса биологической защиты.

2. Микроцентрифуга/вортекс.

3. Настольная центрифуга для микропробирок типа "Эппендорф" объемом 1,5 -2 мл до 10000g.

4. Твердотельный термостат для пробирок объемом 1,5 мл с диапазоном рабочих температур 25-100°C.

5. Вакуумный отсасыватель медицинский с колбой-ловушкой.

6. Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема.

7. Одноразовые полипропиленовые завинчивающиеся или плотно закрывающиеся пробирки объемом 1,5 мл или 2,0 мл.

8. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с фильтром до 200 и до 1000 мкл.

9. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема до 200 мкл.

10. Штативы для наконечников, микропробирок на 1,5 мл.

11. Холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°C и не выше минус 16°C (для хранения наборов, предназначенных для выделения нуклеиновых кислот). Возможно, отдельное использование холодильника с камерой поддерживающей температуру от 2 до 8°C и морозильника, с камерой поддерживающей температуру не выше минус 16°C.

12. Холодильник с камерой поддерживающей температуру от 2 до 8°C (для хранения препаратов нуклеиновых кислот). Не допускается хранение препаратов нуклеиновых кислот в одном холодильнике с компонентами набора для выделения нуклеиновых кислот;

13. Емкость с дезинфицирующим раствором.

14. При исследовании материала, подозрительного на зараженность возбудителями III-IV групп патогенности, не образующими спор, допускается использование автоматизированного оборудования для выделения нуклеиновых кислот.

Рабочая зона 3

1. Бокс биологической безопасности II и III класса или настольный бокс с бактерицидной лампой (ПЦР-бокс; УФ-бокс).

2. Программируемые (персональные, многомодульные, с функцией амплификации в режиме "реального времени") и автоматизированные станции.

2.1. Выбор термоциклера или автоматизированной станции определяется методами амплификации нуклеиновых кислот и коммерческими наборами реагентов, используемыми в лаборатории, характером выполняемых задач и финансовыми возможностями.

3. Флуориметр (флуоресцентный детектор), только при использовании учета продуктов амплификации гибридизационо-флюоресцентным методом детекции по конечной точке.

4. Микроцентрифуга/вортекс.

5. Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема.

6. Одноразовые полипропиленовые пробирки для амплификации объемом 0,5 (0,2) мл.

7. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с фильтром до 10 мкл, 100 мкл и 200 мкл, свободные от РНКаз.

8. Штативы для наконечников, микропробирок на 0,5 (0,2) мл.

9. Холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°C и от минус 180С до минус 25°C (для хранения наборов, предназначенных для проведения обратной транскрипции и амплификации нуклеиновых кислот). Возможно, отдельное использование холодильника с камерой поддерживающей температуру от 2 до 8°C и морозильника, с камерой поддерживающей температуру от минус 180С до минус 25°C.

10. Емкость для сброса отработанных расходных материалов.

11. С целью автоматизации процедуры приготовления реакционных смесей для амплификации допускается использование автоматизированного оборудования для раскапывания реагентов.

Рабочая зона 4-1

Для электрофоретического анализа продуктов амплификации и их очистки для секвенирования*.

1. Камера для горизонтального электрофореза.

2. Источник постоянного тока с напряжением 150-460 В.

3. Ультрафиолетовый трансиллюминатор с кабинетом для просмотра гелей.

4. Видеосистема с цифровой видеокамерой для регистрации результатов.

5. Компьютер (должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов электрофореза).

6. Аквадистиллятор.

7. Микроволновая печь или другой нагревательный прибор для плавления агарозы.

8. Колба коническая из термостойкого стекла для плавления агарозы объемом 250 мл.

9. Мерные цилиндры объемом 100 мл и 1000 мл.

10. Столик и набор гребенок для приготовления геля.

11. Штатив для микропробирок на 0,5 мл.

12. Отдельная автоматическая пипетка переменного объема до 100 мкл.

13. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема до 200 мкл в штативе.

14. Холодильник с камерой, поддерживающей температуру от 2 до 8°C (для хранения наборов электрофоретической детекции).

15. Емкость с дезинфицирующим раствором для сброса отработанных расходных материалов.

16. Пластиковая емкость объемом 5 л для дезактивации буфера и гелей, содержащих бромид этидия.

Для гибридизационно-ферментной детекции продуктов амплификации.

1. Термостат планшетный, поддерживающий температуру 37°С (термошейкер).

2. Вошер (не обязательно).

3. Планшетный спектрофотометр.

4. Компьютер (должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов гибридизации).

5. Восьмиканальная пипетка до 200 мкл.

6. Отдельный набор одноканальных автоматических пипеток переменного объема.

7. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема.

8. Мерный цилиндр объемом 1 л.

9. Комбинированный холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°С (для хранения наборов ГиФА) и не выше минус 16°С (для хранения ампликонов).

10. Емкость для сброса отработанных расходных материалов.

Рабочая зона 4-2

Для секвенирования продуктов амплификации.

Перечень оборудования, необходимого для проведения секвенирования продуктов амплификации, определяется в соответствии с инструкциями по эксплуатации производителей автоматических секвенаторов.

Пример:

1. Автоматический секвенатор;

2. Компьютер (должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов секвенирования);

3. Источник постоянного тока с напряжением 150-460 В.

4. Вортекс;

5. Флуориметр или спектрофотометр;

6. Термостат для пробирок типа "Эппендорф" на 25-100°С;

7. Холодильник с камерой, поддерживающей температуру от 2 до 8°С;

8. Центрифуга;

9. Отдельный набор одноканальных автоматических пипеток переменного объема.

10. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема.

11. Штативы для наконечников, микропробирок на 0,5 (0,2) мл.

12. Емкость для сброса отработанных расходных материалов.

Для гибридизации и анализа продуктов амплификации с помощью ДНК-чипов.

Перечень оборудования, необходимого для проведения детекции продуктов амплификации с помощью ДНК-чипов, определяется в соответствии с инструкциями по применению к данным наборам реагентов.

Пример:

1. Термостат планшетный, поддерживающий температуру 37-60°С.

2. Термостат для пробирок на 200, 500 мкл, поддерживающий температуру 24-99°С.

3. Вошер-инкубатор специализированный для биочипов.

4. Мультиканальный флуоресцентный сканер для биочипов в комплекте с управляющим компьютером (должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов анализа) трифуга низкоскоростная (до 1200g) для больших пробирок (50 мл).

5. Центрифуга низкоскоростная (до 1200g) для больших пробирок (50 мл).

6. Холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°С и от минус 18°С.

7. Отдельный набор одноканальных автоматических пипеток переменного объема.

8. Восьмиканальная пипетка до 200 мкл.

9. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема.

10. Штативы для наконечников, микропробирок на 0,5 (0,2) мл.

11. Емкость для сброса отработанных материалов.

______________________________

* Дополнительное оборудование и расходные материалы, требуемые для осуществления очистки продуктов амплификации (секвенирование).

- стерильный ламинарный шкаф;

- твердотельный термостат для пробирок типа "Эппендорф" на 25-100°С;

- микроцентрифуга от 10000g до 12000g для микроцентрифужных пробирок объемом 1,5 мл или 2,0 мл;

- микроцентрифуга/вортекс;

- вакуумный отсасыватель медицинский с колбой-ловушкой для удаления надосадочной жидкости;

- отдельный набор автоматических пипеток переменного объема;

- одноразовые полипропиленовые завинчивающиеся или плотно закрывающиеся микропробирки объемом 1,5 мл или 2,0 мл;

- штативы для микропробирок объемом 1,5 мл или 2,0 мл и наконечников;

- одноразовые наконечники для пипеток переменного объема в штативах до 200 мкл и до 1000 мкл;

- одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с фильтром до 200 мкл и до 1000 мкл;

- холодильник от 2 до 8°С с морозильной камерой не выше минус 16°С;