Приложение 2. Оборудование и программное обеспечение для проведения исследований методом MALDI-ToF масс-спектрометрии

Приложение 2

Оборудование и программное обеспечение для проведения исследований методом MALDI-ToF масс-спектрометрии

1	MALDI-ToF масс-спектрометр, например: MicroFlex (Braker Daltonik GmbH) или эквивалент
2	MSP-мишень (чип) для нанесения образцов, 96-луночная (Braker Daltonik GmbH, # 224989 или эквивалент)
3	Бокс биологической безопасности II класса тип В
4	Термостат для температурного режима 37°С
5	Термостат для температурного режима 28°С
6	Лабораторная настольная центрифуга с ротором для микропробирок объемом 1,5 мл, до 13 000 об./мин
7	Микроцентрифуга-встряхиватель
8	Дозатор механический одноканальный 0,5 - 10
9	Дозатор механический одноканальный 10 - 100
10	Дозатор механический одноканальный 100 - 1 000
11	Штатив для шести механических дозаторов
12	Таймер-секундомер
13	Колбы мерные градуированные (объемом до 100, 200, 500,1 000 мл)
14	Программы для управления времяпролетными масс-спектрометрами
15	Программы для дальнейшей обработки спектров, полученных с помощью масс-спектрометра. С помощью программы возможно анализировать спектры и сравнивать их друг с другом. Программа содержит алгоритмы для полностью автоматического и интерактивного обнаружения пиков (SNAP, Centroid и Sum peak finder), их сглаживания, вычитания величины сравнения (baseline subtraction), рекалибровки спектров. Поддержка экспорта спектров в различные форматы. Данные, обработанные в программе, могут быть экспортированы в формат списка пиков (peak lists) для дальнейшей обработки
16	Программные пакеты, необходимые для идентификации микроорганизмов в автоматическом и ручном режимах, создания пользовательских баз данных референсных спектров, построения дендрограмм, отображения референсных спектров в виде псевдогелей. Программа дает возможность импортировать результат автоматической идентификации в HTML-файл или распечатать его. Программы выражают результат идентификации в виде коэффициента соответствия (Score Value)