Приложение N 3. Методические рекомендации по проведению микробиологической диагностики внебольничных пневмоний

Приложение N 3
к приказу Министерства здравоохранения
Камчатского края
от 09.04.2020 г. N 195

Методические рекомендации
по проведению микробиологической диагностики внебольничных пневмоний

Согласно Клиническим рекомендациям "Внебольничные пневмонии", разработанным Министерством здравоохранения Российской Федерации, перечень часто встречающихся потенциальных возбудителей внебольничных инфекций представлен Streptococcus pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Haemophilus influenzae, респираторные вирусы, энтеробактерии, Staphylococcus aureus и Legionella pneumophila.

Кроме этого, в связи с пандемией новой коронавирусной инфекции (COVID-19), все случаи внебольничных пневмоний исследуют на COVID-19 в соответствии с постановлением Главного Государственного санитарного врача РФ от 2 марта 2020 г. N 5 "О дополнительных мерах по снижению рисков завоза и распространения новой коронавирусной инфекции".

Централизованная микробиологическая лаборатория ГБУЗ "Камчатская краевая детская инфекционная больница" при поступлении биологического материала от пациентов с диагнозом "Внебольничная пневмония" всеми формами выполняет бактериологические, молекулярно-биологические исследования в соответствии с назначением лечащего врача.

Образцы биологического материала для определения РНК COVID-2019:

- мазок из носоглотки + мазок из ротоглотки отбирается в транспортную среду розового цвета;

- мокрота (при наличии) - исследуется параллельно с другими видами исследований;

- эндотрахеальный аспират (при необходимости диагностики);

- альвеолярный лаваж (при необходимости диагностики);

- кровь или сыворотка для серологического исследования;

- аутопсийный материал при летальном исходе пациента с диагнозом "Внебольничная пневмония":

а) аутоптаты легких;

б) аутоптаты трахеи;

в) аутоптаты селезенки.

Все образцы, собранные для лабораторных исследований, должны рассматриваться, как потенциально инфекционные, и медицинский персонал, который собирает или перевозит клинические образцы, должен строго соблюдать требования биологической безопасности, как при работе с микроорганизмами II группы патогенности.

Микробиологическая диагностика при внебольничной пневмонии включает:

1. Культуральное исследование мокроты и других респираторных образцов - трахеальный аспират (ТА), бронхоальвеолярный лаваж (БАЛ) и др. на микрофлору (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, энтеробактерии, Staphylococcus aureus и др.). Биологический материал в стерильной ёмкости следует доставить в лабораторию в течение 2-х часов.

2. ПЦР-исследование мокроты и других респираторных образцов - трахеальный аспират (ТА), бронхоальвеолярный лаваж (БАЛ) и др. на Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae и Legionella pneumophila. Допускается хранение биоматериала перед транспортировкой в лабораторию при температуре 2 - 8°С, далее образец подвергается замораживанию - 20°С и направляется для исследования в таком виде. Размораживание и повторная заморозка пробы не допускаются!

3. ПЦР-исследование мазков из носо-, ротоглотки и др. на вирусы гриппа А и В, ОРЗ-комплекс. Допускается хранение биоматериала перед транспортировкой в лабораторию при температуре 2-8°С, далее образец подвергается замораживанию - 20°С и направляется для исследования в таком виде. Размораживание и повторная заморозка пробы не допускаются!

Для медицинских организаций, работающих в системе ОМС, биологический материал, указанный в п. 1, 2, 3 направляется для исследования в централизованную микробиологическую лабораторию ГБУЗ "Камчатская краевая детская инфекционная больница".

4. ПЦР-исследование мокроты (БАЛ, ТА), мазков из носо-, ротоглотки и крови на новую коронавирусную инфекцию. Биоматериал отправляют для исследования в централизованную микробиологическую лабораторию ГБУЗ "Камчатская краевая детская инфекционная больница".

Забор крови осуществляется двукратно: в острой фазе и через 2 - 4 недели после острой фазы. Взятые образцы крови не подлежат заморозке.

Правила взятия
и транспортировки клинического материала для диагностики новой коронавирусной инфекции

Отбор проб должен осуществлять обученный медицинский персонал.

При осуществлении забора проб обязательное использование средств индивидуальной защиты.

1. Мазок со слизистой оболочки носоглотки собирают стерильным зондом в пробирку с 2 мл вирусологической транспортной среды. Транспортная среда должна быть розового цвета. Условия хранения данной среды: температура 2 - 8°С в течение 8 недель под визуальным контролем.

2. Забор мокроты (БАЛ, АТ) и мочи осуществляется в стерильные контейнеры.

3. Забор крови осуществляется в вакутейнер с красной крышкой.

ГАРАНТ:

Нумерация пунктов приводится в соответствии с источником

5. Крышки пробирок и ёмкостей следует заклеить пластырем и промаркировать. На этикетке пробирок (контейнеров) с материалом указывается порядковый номер образца, соответствующий номеру в сопроводительном документе, фамилия и инициалы пациента, тип биоматериала. Каждую (!) пробирку, контейнер помещают в индивидуальный пакет с замком. На дно пакета необходимо поместить кусочек гигроскопической ваты!

6. Пакетированные образцы от каждого пациента (кровь, моча, мокрота, мазок из носоглотки) необходимо поместить в общий герметичный пакет.

7. Общие герметичные пакеты далее укладываются в термоконтейнер.

8. Сопроводительные документы помещаются в индивидуальную упаковку отдельно от биологического материала и прочно прикрепляются снаружи контейнера.

9. Транспортирование биопроб производится в термоконтейнерах при температуре от 2 до 8 °С (в течение суток) и при - 20°С с использованием хладоэлементов (больше суток). В контейнер помещается одноразовый индикатор, контролирующий соблюдение требуемого температурного режима.

10. В сопроводительном документе (направлении) указывается дополнительно: ФИО сотрудника, отправившего биоматериал; дата отправки материала и контактный телефон, по которому можно связаться с данным сотрудником.

11. Термоконтейнер направляется курьером на спецтранспорте в ФБУЗ "Центр гигиены и эпидемиологии в Камчатском крае", расположенное по адресу: ул. Владивостокская, д. 9/1.

Техника забора биологического материала

Взятие мазков из носоглотки:

Открыть контейнер с транспортной средой (розовой) для респираторных мазков.

Вскрыть упаковку с зондом.

Перед процедурой провести высмаркивание, если полость носа заполнена слизью.

Салфетку после высмаркивания поместить в красный бак (отходы класса В) для дезинфекции.

Незначительно запрокинуть назад голову пациента, предложить закрыть глаза.

Легким движением по наружной стенке носа вводят сухой зонд на глубину 2 - 3 см. до нижней раковины, слегка опускают к низу, вводят в нижний носовой ход под нижнюю носовую раковину, делают вращательное движение и удаляют вдоль наружной стенки носа. Рабочий конец зонда после взятия мазка у пациента отламывается и помещается в контейнер.

Взятие мазков из ротоглотки:

Мазок берут вращательными движениями с поверхности миндалин, небных дужек, задней стенки ротоглотки (обязательно), аккуратно прижимая язык пациента шпателем. Рабочий конец зонда после взятия мазка у пациента отламывается и помещается в пластиковый контейнер, куда помещен мазок из носоглотки.

Мазок из носоглотки и ротоглотки исследуется как один образец. В транспортной среде обязательно оставлять рабочие концы зондов.

Кровь забирается в вакутейнер с красной крышкой.

Мокрота отбирается аналогично как для бактериологических исследований.

У детей отбираются мазки из носоглотки и ротоглотки, кровь.

Образцы мокроты, респираторных мазков направляются с направлением с дополнительными внешними кодами: А26.06.170.006 (мазки), А26.06.170.007 (мокрота).

Учреждения здравоохранения обеспечиваются пробирками с транспортной средой для мазков в ФБУЗ "Центр гигиены и эпидемиологии в Камчатском крае".